Henrik Jensen (født 25. oktober 1959) er en tidligere dansk fodboldspiller, der er tidligere cheftræner for AC Horsens.

Som spiller spillede han i Vanløse IF og Hvidovre IF, inden han kom til Brøndby IF, hvor han spillede 278 førsteholdskampe.

Som træner var han først assistenttræner for Ebbe Skovdahl. Fra 1999 til 2003 var han cheftræner for Køge Boldklub, som han rykkede op i Superligaen. 2003-2005 var han cheftræner for AB. Herefter blev han træner for Brøndby IFs kvindehold, som han vandt det danske mesterskab med. I 2007 blev han ny assistenttræner for Tom Køhlert i Brøndby. Det var han til Køhlert stoppede 31. december 2008.

Fra 1. januar 2009 blev han træner for AC Horsens, men da klubbens nedrykning i juni samme år blev en realitet, blev Jensen fyret.